Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cnga3Q9JJZ8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cnga3Q9JJZ8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms