Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EefsecQ9JHW4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms