Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms