Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkc1Q9ESX5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms