Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cmtm2bQ9DAC0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms