Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rsph3bQ9DA80 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rsph3bQ9DA80 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rsph3bQ9DA80 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rsph3bQ9DA80 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rsph3bQ9DA80 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rsph3bQ9DA80 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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