Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms