Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Nop56Q9D6Z1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Nop56Q9D6Z1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Nop56Q9D6Z1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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Nop56Q9D6Z1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Nop56Q9D6Z1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Nop56Q9D6Z1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop56Q9D6Z1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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