Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms