Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms