Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cfap53Q9D439 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cfap53Q9D439 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cfap53Q9D439 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cfap53Q9D439 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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