Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pramef12Q9D2F1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pramef12Q9D2F1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pramef12Q9D2F1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms