Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Necap2Q9D1J1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms