Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms