Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1lQ9D1E5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms