Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms