Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm8Q9CXT6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms