Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx47Q9CWX9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms