Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms