Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms