Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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