Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdm1Q9CQK3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms