Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znhit3Q9CQK1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms