Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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