Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms