Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrbp1Q99PL5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms