Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms