Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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