Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms