Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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