Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms