Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms