Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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