Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms