Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarca5Q91ZW3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms