Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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