Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SbsnQ8CIT9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms