Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms