Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc43a2Q8CGA3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms