Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd1bQ8CFT2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd1bQ8CFT2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms