Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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