Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms