Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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