Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4aQ8C9S8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atg4aQ8C9S8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms