Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ifi27Q8C6G0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ifi27Q8C6G0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ifi27Q8C6G0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifi27Q8C6G0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ifi27Q8C6G0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms