Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms