Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8C1R3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8C1R3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8C1R3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8C1R3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8C1R3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8C1R3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms