Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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