Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam53cQ8BXQ8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms