Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp5Q8BX09 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms